Single-cell and spatial transcriptomic profiling of human glioblastomas

This deposition includes scRNA-seq and Spatial Transcriptomics data for 24 GBM patients, which are categorized as follows: a) 7 patients with newly diagnosed GBM (ND group) b) 5 patients with recurrent GBM (Rec group) c) 12 patients who have undergone neoadjuvant therapy (Neo group). Additionally, this deposition contains scRNA-seq data for both wild-type (WT) and SiglecE knockout (KO) mice bearing intracranial CT2A glioma. The provided data includes both the raw matrix and the processed Seurat objects.

本数据集收录24例胶质母细胞瘤（GBM）患者的单细胞RNA测序（scRNA-seq）与空间转录组学（Spatial Transcriptomics）数据，按组别分类如下：
a) 7例初诊胶质母细胞瘤患者（ND组，newly diagnosed GBM）；
b) 5例复发胶质母细胞瘤患者（Rec组，recurrent GBM）；
c) 12例接受新辅助治疗的患者（Neo组，neoadjuvant therapy）。
此外，本数据集还包含携带颅内CT2A胶质瘤的野生型（WT）与SiglecE基因敲除（KO）小鼠的单细胞RNA测序数据。本次提供的数据同时涵盖原始表达矩阵与经处理的Seurat对象。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

该数据集包含24名胶质母细胞瘤（GBM）患者的单细胞RNA测序（scRNA-seq）和空间转录组数据，分为新诊断组（7例）、复发组（5例）和新辅助治疗组（12例）。此外，还包括野生型和SiglecE敲除小鼠颅内CT2A胶质瘤的scRNA-seq数据，提供原始矩阵和处理后的Seurat对象。数据集采用CC BY 4.0许可。