CASOL

CASOL develops an integrative approach to define reference catalogues lncRNAs. This catalogue unifies previously existing annotation sources with transcripts it assembled from stranded/unstranded RNA-seq data collected from various species and cell lines. The BIGTranscriptome catalogue comprises transcripts that are complete at both the 5′ and 3′ ends with CAGE and 3 P-seq evidence.CASOL开发了一套整合性研究方法，用于构建长链非编码RNA (lncRNAs)的参考目录集。该目录集将此前已有的各类转录本注释数据源，与从不同物种及细胞系的链特异性/非链特异性RNA测序 (RNA-seq)数据中组装得到的转录本进行了统一整合。BIGTranscriptome目录集所涵盖的转录本，其5'端与3'端均为完整结构，且均带有帽式基因表达分析 (CAGE)与3'端测序 (3 P-seq)的实验证据支持。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

CASOL是一个综合性长非编码RNA（lncRNA）注释系统，旨在通过整合现有注释来源和从多种物种及细胞系的RNA-Seq数据组装的转录本，构建lncRNA的参考目录。该项目采用整合性方法，以支持对lncRNA功能的深入研究。