Haemosporidian mitochondrial genomes alignments (mtDNA, cox3, cytb, cytb_cox3)

1. The mtDNA genome alignment used to design primer for Haemosporidian parasites was generated in: Pacheco MA, Matta NE, Valkiunas G, Parker PG, Mello B, Stanley CE Jr, Lentino M, Garcia-Amado MA, Cranfield M, Kosakovsky Pond SL, Escalante AA. 2018. Mode and Rate of Evolution of Haemosporidian Mitochondrial Genomes: Timing the Radiation of Avian Parasites. Mol Biol Evol. 2018 Feb 1;35(2):383-403. doi: 10.1093/molbev/msx285. PMID: 29126122 2. Three alignments using mitochondrial genes (cytb, cox3 and cytb plus cox3 concatenated) to do phylogenetic analyses were generated in: M. Andreína Pacheco, Axl S. Cepeda, Rasa Bernotienė, Ingrid, A. Lotta, Nubia E. Matta, Gediminas Valkiūnas, Ananias A. Escalante1. (Submitted to IJP). Primers targeting mitochondrial genes of avian haemosporidians: PCR detection and differential DNA amplification of parasites belonging to different genera.1. 用于设计血孢子虫（Haemosporidian）引物的线粒体DNA（mtDNA）基因组比对文件，其生成来源为：Pacheco MA、Matta NE、Valkiunas G、Parker PG、Mello B、Stanley CE Jr、Lentino M、Garcia-Amado MA、Cranfield M、Kosakovsky Pond SL、Escalante AA。2018年，《血孢子虫线粒体基因组的进化模式与演化速率：鸟类寄生虫辐射演化的时间标定》，发表于《分子生物学与进化（Mol Biol Evol）》，2018年2月1日，第35卷第2期，页码383-403。DOI: 10.1093/molbev/msx285，PMID: 29126122。 2. 用于开展系统发育分析的三组线粒体基因比对文件（分别基于细胞色素b（cytb）、细胞色素氧化酶亚基3（cox3）以及cytb与cox3拼接的联合序列），其生成来源为：M. Andreína Pacheco、Axl S. Cepeda、Rasa Bernotienė、Ingrid、A. Lotta、Nubia E. Matta、Gediminas Valkiūnas、Ananias A. Escalante¹。该研究论文题为《靶向鸟类血孢子虫线粒体基因的引物：不同属寄生虫的PCR检测与差异化DNA扩增》，已投稿至《国际寄生虫学杂志（IJP）》。