巧家五针松基因组数据集

本数据集是巧家五针松（Pinus squamata）及其近缘广布种白皮松（P. bungeana）和西藏白皮松（P. gerardiana）的群体基因组重测序数据与全基因组变异检测结果。共对52株个体（巧家五针松33株、白皮松10株、西藏白皮松9株）进行全基因组重测序，原始数据总产出约24.3 Tb，平均覆盖深度约16.6×。比对到巧家五针松参考基因组后进行全位点SNP分型与严格过滤，得到全基因组VCF文件，用于群体结构、遗传多样性、近交、群体历史和遗传负荷等分析。样本采集自中国云南省（巧家五针松）、山西省（白皮松）和西藏自治区（西藏白皮松）。