基于血浆蛋白质组的器官生物学年龄的量化模型
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资源简介:
本数据产品由CSV数据文件、Joblib模型文件及配套结果文件组成。原始血浆蛋白质组数据在建模前完成质量控制、数据转换及采样地区和性别等系统性影响校正,形成校正后的蛋白表达矩阵。主程序匹配蛋白质组数据与器官生物学年龄标签,将匹配样本划分为训练集和独立测试集;标准化器仅在训练集上拟合,并以相同参数转换测试集。 整体、心血管、肝脏、免疫、代谢、肌肉骨骼、肺和肾脏共8个模型共享1,463个血浆蛋白特征,以Olink蛋白检测指标名称命名。每个模型由支持向量、对偶系数、截距及高斯径向基核参数组成:支持向量保存代表性训练样本的1,463维蛋白值,对偶系数为相应权重,截距校正整体偏移;惩罚系数C、误差容限ε和核宽度γ控制模型拟合。预测时,输入样本按既定特征顺序和训练集参数标准化,计算其与各支持向量的核相似度,加权求和并叠加截距,得到相应器官的蛋白质组生物学年龄。每个目标保存模型、最优参数、训练集与测试集预测及评价结果,共7个文件,8个目标合计56个文件。
提供机构:
中国科学院上海营养与健康研究所创建时间:
2026-08-27
搜集汇总
数据集介绍

背景与挑战
背景概述
该数据集提供了基于血浆蛋白质组学数据量化器官生物学年龄的模型,包含整体、心血管、肝脏等8个器官模型,共享1,463个血浆蛋白特征。每个模型采用支持向量机回归算法,通过质量控制、数据校正和标准化处理,能够预测各器官的蛋白质组生物学年龄。数据集由CSV、Joblib模型文件及配套结果文件组成,共56个文件,支持训练集与独立测试集的模型评估。
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