LncPep

LncPep provides annotations for lncRNAs, peptides and supporting evidence. LncPep totally covers 10,580,228 peptides translated from 883,804 lncRNAs across 39 different species. It provides 7 evidence including Mass Spectrometry, ribosome profiling, Pfam, translation initiation site, N6-methyladenosine modification of RNA sites, CPC2, and CPAT for users to explore and evaluated the predicted peptides.LncPep 提供了长链非编码RNA（long non-coding RNAs，lncRNAs）、多肽以及相关支持证据的注释信息。该数据库共计涵盖来自39个不同物种的883,804条长链非编码RNA所翻译得到的10,580,228条多肽。其提供了7类支持证据，包括质谱（Mass Spectrometry）、核糖体谱（ribosome profiling）、Pfam数据库、翻译起始位点、RNA位点N6-甲基腺嘌呤修饰、CPC2以及CPAT，供用户探索并评估所预测的多肽。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

LncPep是一个专注于长非编码RNA（lncRNA）编码肽段的综合数据库，覆盖了39个不同物种的883,804个lncRNA及其翻译产生的10,580,228个肽段。该数据库整合了质谱、核糖体分析等7种证据类型，以支持用户对预测肽段进行探索和评估。