Table 5 in A revised taxonomy and phylogeny of opalinids (Stramenopiles: Opalinata) inferred from the analysis of complete nuclear ribosomal DNA genes

Table 5. Types of short tandem repeats (STRs) found in the sequences from opalinids. TypeCharacteristicsExampleSequence (position)DirectHead to tailPerfectAll units equalTAATAATAATAATAAOpalina undulata MN 638758 (3423)ImperfectWith substitutions and/or indelsAGTTT ATTTT AATTTZelleriella sp. MN638763 (1762)OverlappedSTR includes basesTTTA[T ATTAT]/ [TAT TAT] TATProtoopalina limnocharis MN 638759 (1493/1497)InvertedHead to headPerfectAll units equalTTTATAATATTTOpalina triangulata MN 638762 (470)ImperfectWith substitutions and/or indelsTTATTATTATTATTTTTTTTATTA(-) TATTATTOpalina japonica MN 638764 (73)表5 偏滴虫类（opalinids）序列中发现的短串联重复序列（short tandem repeats, STR）类型 1. 正向头-尾串联完全型 特征：所有重复单元完全一致 示例序列：TAATAATAATAATAA 对应物种与位置：波纹斜管虫（Opalina undulata）MN 638758（位置3423） 2. 正向头-尾串联不完全型 特征：存在碱基替换和/或插入缺失 示例序列：AGTTT ATTTT AATTT 对应物种与位置：齐勒虫属未定种（Zelleriella sp.）MN638763（位置1762） 3. 重叠型 特征：STR序列包含重叠碱基单元 示例序列：TTTA[T ATTAT]/ [TAT TAT] TAT 对应物种与位置：沼生原斜管虫（Protoopalina limnocharis）MN 638759（位置1493/1497） 4. 反向头-头串联完全型 特征：所有重复单元完全一致 示例序列：TTTATAATATTT 对应物种与位置：三角斜管虫（Opalina triangulata）MN 638762（位置470） 5. 反向头-头串联不完全型 特征：存在碱基替换和/或插入缺失 示例序列：TTATTATTATTATTTTTTTTATTA(-) TATTATT 对应物种与位置：日本斜管虫（Opalina japonica）MN 638764（位置73）