HIV drug resistance mutation detection by standard sequencing (ss) and ultra-deep sequencing (uds).

NOTE: (), % abundance by uds.AZT, zidovudine; ABC, abacavir; 3TC, lamivudine; FTC, emtricitabine; DDI, didanosine.Mutations in bold, IAS-USA major mutations in low abundance.Mutation in italic, mutations detected by uds only.TDF, tenofovir; D4T, stavudine; EFV, efavirenz; LPV, lopinavir; SQV, saquinavir; fAMP, fosamprenavir; NLF, nelfinavir; ATV, atazanavir; r, ritonavir boosting.注：基于uds的丰度百分比相关缩写及对应通用名如下：齐多夫定（zidovudine，AZT）、阿巴卡韦（abacavir，ABC）、拉米夫定（lamivudine，3TC）、恩曲他滨（emtricitabine，FTC）、去羟肌苷（didanosine，DDI）。 加粗字体标注的突变为美国国际艾滋病学会（IAS-USA）认定的低丰度主要耐药突变。 斜体字体标注的突变为仅通过uds检测到的突变。 其余相关药物缩写及对应通用名如下：替诺福韦（tenofovir，TDF）、司他夫定（stavudine，D4T）、依非韦伦（efavirenz，EFV）、洛匹那韦（lopinavir，LPV）、沙奎那韦（saquinavir，SQV）、福沙那韦（fosamprenavir，fAMP）、奈非那韦（nelfinavir，NLF）、阿扎那韦（atazanavir，ATV）、利托那韦增效（ritonavir boosting，r）。