犬粪便变形菌门携带率研究数据
收藏资源简介:
变形菌门是一类革兰氏阴性菌,广泛存活于环境,粘膜,肠道中。变形菌门是一种重要的肠道微生物,是丰度最高的细菌门之一,被视为肠道菌群失调或宿主病理状态的潜在微生物标志物。变形菌门可在人与宠物之间广泛传播,影响人类健康。了解犬粪便中变形菌门的携带率对于评估公共卫生风险具有重要意义,为疾病预防和控制提供科学依据,保障宠物及人类健康。犬粪便变形菌门携带率研究还可以为流行病学的研究提供数据支持,有助于确定中国本土区域宠物中变形菌门的本底流行水平,为判断后续可能出现的异常流行情况提供基线参照。关于外部复用价值,对于卫生监管部门,可作为发布官方健康指数,溯源流行病发展,监测环境疾病预防的核心工具,对于医院,可作为疾病诊断的辅助措施,为提供微生态视角的诊断线索。1、数据采集:从宠物医院收集一批(1001只)犬粪便样本,按照1-1001的顺序进行样本编号,样本批次为KY1,并对基础信息、临床资料进行分析调查。2、数据检测:对收集到的1001只动物粪便样本分别进行16S微生物测序,按照16S微生物测序数据分析流程进行数据分析,在属水平上统计变形菌门检出量%,变形菌门检出量%大于0的样本检测结果标记为阳性,等于0 的检测结果标记为阴性。3、数据处理:① 统计阳性总数,平均携带率=阳性总数/样本总数;② 平均携带丰度%=AVERAGE(变形菌门检出量%);③ 将变形菌门检出量按照从小到大的顺序排序,四分位数Q3= 3(n + 1)/4位置的检测数值,n为样本总数。 4、数据应用:利用PYTHON收集群体样本变形菌门检出量%,用MATPLOTLIB将该数据画出拟合图,便于研究人员观察分析。5、数据分类分级:将计算出的变形菌门检出量%进行指标评价,分为“高、中、低“不同的类别和级别(变形菌门检出量%值大于四分位数Q3的为“高”,大于0且小于等于四分位数Q3为“中”,值为0的为“低”)。




