TeloBase

TeloBase is a curated database containing computationally predicted and experimentally confirmed telomere sequences of species across the whole tree of life. It contains information from the literature (1978 – September 2022) and predicted telomere motifs from publicly available NGS data stored in the SRA database (NCBI) and user submitted data. TeloBase is supplemented by internal taxonomy utilizing popular on-line taxonomic resources that enables in-house data filtration and graphical visualisation of telomere DNA evolutionary dynamics in the form of heat tree plots. Its manual and other relevant data (raw results from NGS data analysis and Atlas of telomere sequences) can be accessed on https://www.ceitec.eu/chromatin-molecular-complexes/rg51/tab?tabId=125#TeloBase.TeloBase是一款经人工整理的精选数据库，收录了生命之树全物种类群的端粒序列，这些序列兼具计算预测与实验验证两种来源。该库涵盖1978年至2022年9月期间的文献资料，以及存储于NCBI的SRA数据库中的公开NGS数据与用户提交数据中预测得到的端粒基序。TeloBase还辅以基于主流在线分类学资源构建的内部分类体系，可实现内部数据筛选，并以热树图（heat tree plots）的形式可视化端粒DNA的进化动态。其使用手册及其他相关数据（包括NGS数据分析的原始结果与端粒序列图谱集）可通过https://www.ceitec.eu/chromatin-molecular-complexes/rg51/tab?tabId=125#TeloBase访问。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

TeloBase是一个经过整理的数据库，收录了涵盖整个生命树物种的计算预测和实验证实的端粒序列，数据来源于文献及公开数据库。它集成了内部分类学工具，支持数据过滤并以热树图形式展示端粒DNA的进化动态。