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We implemented a database visualization module in IBS 2.0, enabling batch visualization of biological sequences from the UniProt and the NCBI RefSeq databases. Furthermore, to increase the design efficiency, a resource platform that allows uploading, retrieval, and browsing of existing biological sequence diagrams has been integrated into IBS 2.0. In addition, a lightweight JS library was developed in IBS 2.0 to assist the visualization of biological sequences in customized web services.

我们在IBS 2.0中开发了数据库可视化模块,可实现来自通用蛋白资源库(UniProt)与美国国家生物技术信息中心参考序列库(NCBI RefSeq)的生物序列批量可视化。为提升设计效率,IBS 2.0还集成了一款资源平台,支持对现有生物序列图谱进行上传、检索与浏览。此外,IBS 2.0还开发了轻量级JS库,用于辅助自定义Web服务中的生物序列可视化工作。

提供机构:
中山大学
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背景与挑战
背景概述
IBS 2.0是一个基于Web的开放资源工具,旨在帮助实验人员绘制高质量的蛋白质和核苷酸序列示意图。它提供双模式用户界面、丰富的图形元素,并支持从UniProt和NCBI RefSeq数据库自动检索数据,同时集成了资源平台用于共享和编辑序列图,以及轻量级JS库以方便Web服务集成。
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