ASFVdb

To control the transmission of ASF virus (ASFV), we developed the African swine fever virus database (ASFVdb), an online data visualization and analysis platform for comparative genomics and proteomics. On the basis of known ASFV genes, ASFVdb reannotates the genomes of every strain and newly annotates 5352 possible open reading frames (ORFs) of 45 strains. Moreover, ASFVdb performs a thorough analysis of the population genetics of all the published genomes of ASFV strains and performs functional and structural predictions for all genes.为防控非洲猪瘟病毒（African swine fever virus, ASFV），我们构建了非洲猪瘟病毒数据库（ASFVdb）——一款面向比较基因组学与蛋白质组学研究的在线数据可视化与分析平台。该数据库基于已公开的ASFV基因信息，对所有毒株的基因组进行了重新注释，并为45株毒株新注释了5352个潜在开放阅读框（open reading frame, ORF）。此外，ASFVdb还对所有已发表的ASFV毒株基因组开展了全面的群体遗传学分析，并为所有基因完成了功能与结构预测。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

ASFVdb是一个针对非洲猪瘟病毒的在线数据可视化与分析平台，专注于比较基因组学和蛋白质组学研究。该数据库重新注释了所有已知菌株的基因组，新注释了45个菌株的5352个可能开放阅读框，并提供了群体遗传学分析以及基因功能与结构预测。